Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccr5P51682 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms