Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FmodP50608 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FmodP50608 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FmodP50608 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FmodP50608 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FmodP50608 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FmodP50608 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FmodP50608 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FmodP50608 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FmodP50608 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FmodP50608 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FmodP50608 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FmodP50608 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FmodP50608 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FmodP50608 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FmodP50608 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FmodP50608 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FmodP50608 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FmodP50608 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FmodP50608 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
FmodP50608 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
FmodP50608 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FmodP50608 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FmodP50608 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FmodP50608 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FmodP50608 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FmodP50608 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FmodP50608 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FmodP50608 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FmodP50608 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FmodP50608 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FmodP50608 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FmodP50608 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FmodP50608 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FmodP50608 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FmodP50608 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FmodP50608 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FmodP50608 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FmodP50608 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FmodP50608 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FmodP50608 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FmodP50608 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FmodP50608 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FmodP50608 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FmodP50608 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FmodP50608 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FmodP50608 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FmodP50608 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FmodP50608 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FmodP50608 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
FmodP50608 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
FmodP50608 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FmodP50608 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
FmodP50608 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
FmodP50608 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
FmodP50608 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
FmodP50608 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FmodP50608 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FmodP50608 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
FmodP50608 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
FmodP50608 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FmodP50608 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FmodP50608 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FmodP50608 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FmodP50608 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FmodP50608 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
FmodP50608 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FmodP50608 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FmodP50608 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FmodP50608 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
FmodP50608 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
FmodP50608 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FmodP50608 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FmodP50608 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FmodP50608 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
FmodP50608 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FmodP50608 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FmodP50608 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FmodP50608 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FmodP50608 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FmodP50608 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FmodP50608 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FmodP50608 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FmodP50608 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FmodP50608 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FmodP50608 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
FmodP50608 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FmodP50608 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
FmodP50608 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FmodP50608 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FmodP50608 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
FmodP50608 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FmodP50608 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
FmodP50608 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
FmodP50608 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
FmodP50608 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
FmodP50608 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FmodP50608 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
FmodP50608 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FmodP50608 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms