Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psen1P49769 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psen1P49769 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psen1P49769 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psen1P49769 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psen1P49769 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psen1P49769 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Psen1P49769 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psen1P49769 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psen1P49769 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psen1P49769 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Psen1P49769 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psen1P49769 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psen1P49769 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms