Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpreP49446 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpreP49446 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtpreP49446 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpreP49446 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpreP49446 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpreP49446 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpreP49446 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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