Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms