Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syt1P46096 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syt1P46096 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syt1P46096 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syt1P46096 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syt1P46096 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syt1P46096 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syt1P46096 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syt1P46096 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syt1P46096 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syt1P46096 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syt1P46096 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt1P46096 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt1P46096 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt1P46096 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syt1P46096 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms