Protein–RNA interactions for Protein: P41778

Pbx1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, mousemouse

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Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx1P41778 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbx1P41778 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbx1P41778 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbx1P41778 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbx1P41778 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbx1P41778 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbx1P41778 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbx1P41778 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbx1P41778 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbx1P41778 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbx1P41778 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbx1P41778 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbx1P41778 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbx1P41778 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbx1P41778 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbx1P41778 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbx1P41778 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbx1P41778 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbx1P41778 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbx1P41778 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbx1P41778 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pbx1P41778 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pbx1P41778 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pbx1P41778 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pbx1P41778 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pbx1P41778 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pbx1P41778 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pbx1P41778 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pbx1P41778 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pbx1P41778 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pbx1P41778 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pbx1P41778 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pbx1P41778 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pbx1P41778 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pbx1P41778 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pbx1P41778 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pbx1P41778 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pbx1P41778 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pbx1P41778 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pbx1P41778 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pbx1P41778 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pbx1P41778 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pbx1P41778 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pbx1P41778 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pbx1P41778 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbx1P41778 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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