Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rfc1P35601 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms