Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoc1P34928 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms