Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Mmp13P33435 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Mmp13P33435 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Mmp13P33435 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Mmp13P33435 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp13P33435 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Mmp13P33435 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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