Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc10P31257 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms