Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms