Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc1P29341 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc1P29341 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc1P29341 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc1P29341 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc1P29341 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc1P29341 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Pabpc1P29341 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
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Pabpc1P29341 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Pabpc1P29341 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Pabpc1P29341 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
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Pabpc1P29341 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc1P29341 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc1P29341 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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