Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxraP28700 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxraP28700 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxraP28700 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxraP28700 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxraP28700 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxraP28700 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxraP28700 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxraP28700 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxraP28700 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxraP28700 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxraP28700 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxraP28700 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxraP28700 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxraP28700 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxraP28700 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxraP28700 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RxraP28700 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RxraP28700 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxraP28700 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxraP28700 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxraP28700 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxraP28700 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxraP28700 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxraP28700 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxraP28700 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxraP28700 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxraP28700 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxraP28700 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxraP28700 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxraP28700 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxraP28700 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxraP28700 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxraP28700 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxraP28700 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxraP28700 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxraP28700 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxraP28700 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxraP28700 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxraP28700 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RxraP28700 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxraP28700 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxraP28700 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RxraP28700 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxraP28700 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxraP28700 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxraP28700 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxraP28700 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxraP28700 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxraP28700 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxraP28700 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxraP28700 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxraP28700 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RxraP28700 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RxraP28700 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RxraP28700 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RxraP28700 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RxraP28700 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
RxraP28700 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RxraP28700 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RxraP28700 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxraP28700 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxraP28700 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RxraP28700 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxraP28700 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxraP28700 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxraP28700 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxraP28700 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxraP28700 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxraP28700 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxraP28700 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxraP28700 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxraP28700 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxraP28700 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxraP28700 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxraP28700 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RxraP28700 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxraP28700 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxraP28700 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxraP28700 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxraP28700 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RxraP28700 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxraP28700 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxraP28700 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxraP28700 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxraP28700 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxraP28700 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxraP28700 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxraP28700 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxraP28700 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxraP28700 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxraP28700 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxraP28700 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RxraP28700 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxraP28700 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxraP28700 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxraP28700 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxraP28700 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxraP28700 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxraP28700 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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