Protein–RNA interactions for Protein: P28660

Nckap1, Nck-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap1P28660 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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