Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms