Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
U2af2P26369 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
U2af2P26369 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
U2af2P26369 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
U2af2P26369 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
U2af2P26369 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
U2af2P26369 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
U2af2P26369 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
U2af2P26369 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
U2af2P26369 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
U2af2P26369 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms