Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms