Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk11bP24788 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk11bP24788 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk11bP24788 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk11bP24788 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk11bP24788 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk11bP24788 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms