Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd247P24161 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd247P24161 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd247P24161 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd247P24161 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd247P24161 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd247P24161 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd247P24161 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd247P24161 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd247P24161 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms