Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcer1aP20489 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcer1aP20489 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcer1aP20489 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcer1aP20489 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcer1aP20489 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcer1aP20489 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcer1aP20489 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcer1aP20489 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcer1aP20489 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcer1aP20489 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcer1aP20489 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcer1aP20489 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcer1aP20489 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcer1aP20489 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcer1aP20489 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcer1aP20489 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcer1aP20489 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcer1aP20489 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcer1aP20489 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcer1aP20489 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcer1aP20489 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcer1aP20489 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcer1aP20489 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcer1aP20489 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcer1aP20489 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcer1aP20489 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcer1aP20489 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcer1aP20489 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcer1aP20489 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcer1aP20489 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcer1aP20489 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Fcer1aP20489 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Fcer1aP20489 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Fcer1aP20489 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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