Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TP20293 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TP20293 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
TP20293 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TP20293 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
TP20293 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TP20293 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
TP20293 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
TP20293 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TP20293 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TP20293 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
TP20293 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TP20293 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
TP20293 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TP20293 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TP20293 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TP20293 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TP20293 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TP20293 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TP20293 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TP20293 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TP20293 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TP20293 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TP20293 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TP20293 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TP20293 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TP20293 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TP20293 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TP20293 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TP20293 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TP20293 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TP20293 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TP20293 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TP20293 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TP20293 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TP20293 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TP20293 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TP20293 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TP20293 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TP20293 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TP20293 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TP20293 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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TP20293 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TP20293 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TP20293 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TP20293 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TP20293 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TP20293 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TP20293 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TP20293 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TP20293 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TP20293 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TP20293 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TP20293 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TP20293 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TP20293 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TP20293 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TP20293 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TP20293 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TP20293 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TP20293 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TP20293 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TP20293 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TP20293 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TP20293 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TP20293 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TP20293 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TP20293 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TP20293 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TP20293 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TP20293 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TP20293 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TP20293 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TP20293 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TP20293 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TP20293 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TP20293 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TP20293 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TP20293 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TP20293 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TP20293 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TP20293 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TP20293 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TP20293 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TP20293 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TP20293 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TP20293 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TP20293 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TP20293 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TP20293 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TP20293 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TP20293 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TP20293 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TP20293 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TP20293 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TP20293 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TP20293 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TP20293 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TP20293 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms