Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lama1P19137 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Lama1P19137 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lama1P19137 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lama1P19137 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lama1P19137 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lama1P19137 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Lama1P19137 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lama1P19137 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Lama1P19137 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lama1P19137 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lama1P19137 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lama1P19137 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lama1P19137 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lama1P19137 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lama1P19137 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lama1P19137 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lama1P19137 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lama1P19137 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lama1P19137 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lama1P19137 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lama1P19137 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lama1P19137 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lama1P19137 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lama1P19137 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lama1P19137 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lama1P19137 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lama1P19137 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lama1P19137 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lama1P19137 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lama1P19137 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lama1P19137 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lama1P19137 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lama1P19137 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lama1P19137 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lama1P19137 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lama1P19137 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lama1P19137 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lama1P19137 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lama1P19137 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lama1P19137 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lama1P19137 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lama1P19137 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lama1P19137 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lama1P19137 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lama1P19137 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Lama1P19137 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Lama1P19137 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Lama1P19137 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lama1P19137 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lama1P19137 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lama1P19137 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lama1P19137 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lama1P19137 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lama1P19137 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lama1P19137 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lama1P19137 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lama1P19137 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lama1P19137 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lama1P19137 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lama1P19137 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lama1P19137 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lama1P19137 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lama1P19137 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lama1P19137 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lama1P19137 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lama1P19137 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lama1P19137 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lama1P19137 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lama1P19137 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lama1P19137 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lama1P19137 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lama1P19137 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lama1P19137 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lama1P19137 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lama1P19137 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lama1P19137 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lama1P19137 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lama1P19137 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lama1P19137 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lama1P19137 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lama1P19137 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lama1P19137 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lama1P19137 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lama1P19137 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lama1P19137 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lama1P19137 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lama1P19137 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lama1P19137 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lama1P19137 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lama1P19137 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lama1P19137 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lama1P19137 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lama1P19137 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lama1P19137 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lama1P19137 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lama1P19137 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lama1P19137 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lama1P19137 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lama1P19137 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms