Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18532 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18532 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18532 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18532 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18532 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18532 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18532 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18532 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18532 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18532 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18532 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18532 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18532 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18532 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18532 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18532 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18532 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18532 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
P18532 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
P18532 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18532 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18532 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18532 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18532 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
P18532 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18532 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18532 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18532 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18532 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18532 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18532 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18532 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18532 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18532 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18532 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18532 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18532 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18532 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18532 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18532 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18532 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18532 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18532 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18532 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18532 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18532 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18532 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18532 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18532 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18532 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18532 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18532 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18532 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
P18532 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18532 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
P18532 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
P18532 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
P18532 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18532 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
P18532 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18532 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18532 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18532 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18532 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18532 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18532 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18532 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18532 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18532 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18532 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18532 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18532 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18532 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
P18532 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18532 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18532 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18532 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18532 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18532 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18532 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18532 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18532 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18532 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18532 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18532 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18532 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18532 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18532 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18532 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18532 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18532 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18532 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18532 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18532 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18532 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18532 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18532 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18532 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
P18532 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms