Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms