Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
PcnaP17918 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PcnaP17918 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PcnaP17918 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PcnaP17918 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PcnaP17918 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PcnaP17918 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PcnaP17918 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PcnaP17918 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms