Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

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Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tgfb3P17125 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tgfb3P17125 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tgfb3P17125 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tgfb3P17125 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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