Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd44P15379 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd44P15379 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd44P15379 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd44P15379 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd44P15379 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd44P15379 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd44P15379 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms