Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms