Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Npm1-204ENSMUST00000109354 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 AC153968.2-201ENSMUST00000215579 1140 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 AC131743.3-201ENSMUST00000222099 662 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Olfr1480-203ENSMUST00000207904 1209 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Acrbp-201ENSMUST00000032481 584 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Olfr1480-201ENSMUST00000072219 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Gm45151-201ENSMUST00000205445 712 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms