Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms