Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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