Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TtrP07309 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TtrP07309 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TtrP07309 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TtrP07309 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TtrP07309 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TtrP07309 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TtrP07309 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TtrP07309 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TtrP07309 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TtrP07309 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TtrP07309 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
TtrP07309 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TtrP07309 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TtrP07309 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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TtrP07309 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
TtrP07309 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
TtrP07309 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TtrP07309 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
TtrP07309 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TtrP07309 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TtrP07309 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TtrP07309 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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TtrP07309 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TtrP07309 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TtrP07309 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TtrP07309 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TtrP07309 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TtrP07309 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TtrP07309 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TtrP07309 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TtrP07309 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TtrP07309 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TtrP07309 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TtrP07309 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TtrP07309 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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TtrP07309 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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TtrP07309 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TtrP07309 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TtrP07309 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TtrP07309 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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TtrP07309 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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TtrP07309 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TtrP07309 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TtrP07309 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TtrP07309 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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TtrP07309 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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TtrP07309 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
TtrP07309 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
TtrP07309 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
TtrP07309 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
TtrP07309 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TtrP07309 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TtrP07309 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TtrP07309 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TtrP07309 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TtrP07309 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TtrP07309 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TtrP07309 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TtrP07309 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TtrP07309 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TtrP07309 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TtrP07309 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TtrP07309 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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