Protein–RNA interactions for Protein: P02772

Afp, Alpha-fetoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AfpP02772 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AfpP02772 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AfpP02772 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AfpP02772 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AfpP02772 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AfpP02772 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AfpP02772 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AfpP02772 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AfpP02772 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AfpP02772 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AfpP02772 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AfpP02772 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AfpP02772 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AfpP02772 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AfpP02772 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AfpP02772 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AfpP02772 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AfpP02772 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AfpP02772 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AfpP02772 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AfpP02772 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AfpP02772 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AfpP02772 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AfpP02772 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AfpP02772 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AfpP02772 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AfpP02772 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AfpP02772 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
AfpP02772 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
AfpP02772 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AfpP02772 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AfpP02772 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AfpP02772 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AfpP02772 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AfpP02772 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AfpP02772 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AfpP02772 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AfpP02772 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AfpP02772 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AfpP02772 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AfpP02772 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AfpP02772 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AfpP02772 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AfpP02772 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AfpP02772 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AfpP02772 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AfpP02772 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AfpP02772 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AfpP02772 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AfpP02772 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AfpP02772 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AfpP02772 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AfpP02772 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AfpP02772 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AfpP02772 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AfpP02772 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AfpP02772 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AfpP02772 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AfpP02772 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AfpP02772 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AfpP02772 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AfpP02772 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AfpP02772 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AfpP02772 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AfpP02772 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AfpP02772 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AfpP02772 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AfpP02772 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AfpP02772 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AfpP02772 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AfpP02772 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AfpP02772 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AfpP02772 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AfpP02772 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AfpP02772 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AfpP02772 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AfpP02772 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AfpP02772 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AfpP02772 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AfpP02772 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AfpP02772 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AfpP02772 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AfpP02772 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AfpP02772 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AfpP02772 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AfpP02772 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AfpP02772 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AfpP02772 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AfpP02772 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AfpP02772 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AfpP02772 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AfpP02772 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AfpP02772 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AfpP02772 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AfpP02772 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AfpP02772 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AfpP02772 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AfpP02772 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AfpP02772 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AfpP02772 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms