Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casp8O89110 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Casp8O89110 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp8O89110 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp8O89110 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp8O89110 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp8O89110 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp8O89110 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp8O89110 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms