Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Ccl20O89093 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Ccl20O89093 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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