Protein–RNA interactions for Protein: O88575

Slc6a20b, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3B, mousemouse

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Length 635 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20bO88575 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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Slc6a20bO88575 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc6a20bO88575 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc6a20bO88575 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc6a20bO88575 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc6a20bO88575 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc6a20bO88575 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc6a20bO88575 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc6a20bO88575 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc6a20bO88575 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc6a20bO88575 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc6a20bO88575 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc6a20bO88575 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc6a20bO88575 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc6a20bO88575 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc6a20bO88575 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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Slc6a20bO88575 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Slc6a20bO88575 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Slc6a20bO88575 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a20bO88575 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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