Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AvilO88398 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AvilO88398 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AvilO88398 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AvilO88398 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AvilO88398 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AvilO88398 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AvilO88398 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AvilO88398 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AvilO88398 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AvilO88398 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AvilO88398 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AvilO88398 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AvilO88398 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AvilO88398 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AvilO88398 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AvilO88398 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AvilO88398 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AvilO88398 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AvilO88398 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AvilO88398 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AvilO88398 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AvilO88398 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AvilO88398 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AvilO88398 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AvilO88398 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AvilO88398 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AvilO88398 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AvilO88398 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AvilO88398 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AvilO88398 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AvilO88398 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AvilO88398 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AvilO88398 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AvilO88398 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AvilO88398 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AvilO88398 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AvilO88398 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AvilO88398 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
AvilO88398 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
AvilO88398 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AvilO88398 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AvilO88398 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AvilO88398 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AvilO88398 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AvilO88398 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AvilO88398 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AvilO88398 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AvilO88398 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AvilO88398 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AvilO88398 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AvilO88398 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AvilO88398 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AvilO88398 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AvilO88398 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AvilO88398 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AvilO88398 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AvilO88398 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AvilO88398 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AvilO88398 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AvilO88398 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AvilO88398 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AvilO88398 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AvilO88398 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AvilO88398 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AvilO88398 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AvilO88398 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AvilO88398 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AvilO88398 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AvilO88398 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AvilO88398 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AvilO88398 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AvilO88398 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AvilO88398 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AvilO88398 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AvilO88398 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
AvilO88398 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AvilO88398 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AvilO88398 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AvilO88398 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AvilO88398 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AvilO88398 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AvilO88398 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AvilO88398 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
AvilO88398 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AvilO88398 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AvilO88398 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AvilO88398 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AvilO88398 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AvilO88398 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AvilO88398 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AvilO88398 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AvilO88398 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AvilO88398 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AvilO88398 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AvilO88398 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AvilO88398 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AvilO88398 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AvilO88398 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AvilO88398 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms