Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Tnnt1O88346 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
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Tnnt1O88346 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Tnnt1O88346 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Tnnt1O88346 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Tnnt1O88346 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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