Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms