Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ChkbO55229 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChkbO55229 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChkbO55229 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChkbO55229 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChkbO55229 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChkbO55229 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChkbO55229 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChkbO55229 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChkbO55229 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChkbO55229 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms