Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms