Protein–RNA interactions for Protein: O54965

Rnf13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf13O54965 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf13O54965 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf13O54965 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf13O54965 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf13O54965 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf13O54965 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf13O54965 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf13O54965 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf13O54965 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf13O54965 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf13O54965 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf13O54965 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Rnf13O54965 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf13O54965 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf13O54965 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Rnf13O54965 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf13O54965 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf13O54965 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf13O54965 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf13O54965 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rnf13O54965 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rnf13O54965 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf13O54965 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rnf13O54965 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf13O54965 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf13O54965 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rnf13O54965 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf13O54965 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rnf13O54965 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf13O54965 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf13O54965 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf13O54965 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf13O54965 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rnf13O54965 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf13O54965 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rnf13O54965 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rnf13O54965 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rnf13O54965 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rnf13O54965 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf13O54965 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf13O54965 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf13O54965 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf13O54965 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf13O54965 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf13O54965 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf13O54965 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf13O54965 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf13O54965 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rnf13O54965 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf13O54965 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf13O54965 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf13O54965 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf13O54965 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf13O54965 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf13O54965 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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