Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2f6O54917 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
E2f6O54917 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2f6O54917 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2f6O54917 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2f6O54917 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2f6O54917 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2f6O54917 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2f6O54917 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f6O54917 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f6O54917 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms