Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pik3cdO35904 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Pik3cdO35904 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pik3cdO35904 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms