Protein–RNA interactions for Protein: O35595

Ptch2, Protein patched homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptch2O35595 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ptch2O35595 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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