Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc27a2O35488 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc27a2O35488 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms