Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atf6bO35451 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atf6bO35451 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atf6bO35451 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atf6bO35451 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atf6bO35451 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atf6bO35451 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atf6bO35451 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atf6bO35451 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atf6bO35451 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Atf6bO35451 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Atf6bO35451 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atf6bO35451 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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