Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms