Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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